More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1114 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
420 aa  846    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  66.67 
 
 
425 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.54 
 
 
442 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61 
 
 
430 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.08 
 
 
416 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.56 
 
 
425 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  57.14 
 
 
419 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.61 
 
 
436 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  55.16 
 
 
423 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  56.67 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  53.04 
 
 
428 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  47.1 
 
 
431 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.15 
 
 
393 aa  359  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.06 
 
 
396 aa  352  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  48.37 
 
 
390 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  48.48 
 
 
395 aa  349  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  48.33 
 
 
414 aa  346  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  48.72 
 
 
402 aa  342  9e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
387 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  48.72 
 
 
402 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  48.72 
 
 
402 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  46.1 
 
 
444 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  52.28 
 
 
411 aa  332  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.78 
 
 
399 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  52.13 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.19 
 
 
400 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  47 
 
 
403 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
402 aa  319  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.8 
 
 
401 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  50.93 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.56 
 
 
393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.59 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  43.36 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.99 
 
 
394 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.48 
 
 
397 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
394 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
398 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.4 
 
 
396 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 
398 aa  296  4e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.35 
 
 
397 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
395 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  43.32 
 
 
398 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.45 
 
 
399 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
403 aa  296  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  40.47 
 
 
396 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.22 
 
 
383 aa  292  6e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.77 
 
 
400 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  43.07 
 
 
400 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
398 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.8 
 
 
393 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.84 
 
 
399 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
398 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  40.8 
 
 
396 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
398 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
398 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  41.18 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
385 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  42.03 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
395 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  41.27 
 
 
395 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.94 
 
 
385 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  42.55 
 
 
404 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
402 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.15 
 
 
374 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.48 
 
 
396 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  41.48 
 
 
418 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.25 
 
 
417 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.56 
 
 
399 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1662  aminotransferase class-III  43.83 
 
 
388 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  41.16 
 
 
404 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  37.26 
 
 
423 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.18 
 
 
396 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  42.22 
 
 
410 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  39.5 
 
 
399 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
426 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
387 aa  276  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
404 aa  276  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  38.97 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  36.74 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.92 
 
 
396 aa  273  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  41.28 
 
 
422 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  36.74 
 
 
418 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  41.34 
 
 
380 aa  274  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  38.66 
 
 
427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  42.12 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.14 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.27 
 
 
427 aa  273  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.57 
 
 
385 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  37.69 
 
 
426 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  41.12 
 
 
397 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  38.72 
 
 
388 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  40.3 
 
 
392 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
418 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>