More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4178 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
243 aa  470  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 
248 aa  314  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  70.4 
 
 
239 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  70.4 
 
 
238 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  67.27 
 
 
236 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  66.08 
 
 
242 aa  288  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  60.26 
 
 
241 aa  254  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  52.94 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  54.02 
 
 
283 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  53.57 
 
 
253 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  51.95 
 
 
248 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  50.85 
 
 
266 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  53.18 
 
 
253 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  52.97 
 
 
253 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  51.19 
 
 
254 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  52.23 
 
 
251 aa  224  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 
251 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
266 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  50.61 
 
 
254 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  53.6 
 
 
255 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  51.82 
 
 
234 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  51.82 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  50.45 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  46.96 
 
 
245 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  51.58 
 
 
255 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  49.09 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  49.3 
 
 
262 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
245 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
248 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
248 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
248 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
248 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  46.75 
 
 
245 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
245 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  46.09 
 
 
247 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  49.55 
 
 
246 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 
247 aa  207  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 
260 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 
260 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 
253 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  44.9 
 
 
246 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
247 aa  204  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
246 aa  204  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
248 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
248 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
248 aa  204  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  47.39 
 
 
248 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  46.38 
 
 
246 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  46.38 
 
 
246 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  49.53 
 
 
250 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  41.83 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  43.72 
 
 
255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  45.19 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  43.83 
 
 
255 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 
245 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  52.25 
 
 
264 aa  197  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  46.7 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  52.83 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  48.11 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  46.32 
 
 
252 aa  194  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
249 aa  194  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  41.44 
 
 
252 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  45 
 
 
256 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
251 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  41.41 
 
 
262 aa  191  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 
280 aa  191  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  43.6 
 
 
248 aa  191  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  43.87 
 
 
252 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  43.93 
 
 
251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  46.45 
 
 
253 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
251 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  48.02 
 
 
247 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
281 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  44.81 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  47.52 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  45.5 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  43.13 
 
 
247 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 
252 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  46.26 
 
 
289 aa  188  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  43.6 
 
 
248 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
276 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  44.5 
 
 
250 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
276 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  48.11 
 
 
251 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
276 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  44.08 
 
 
255 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  41.36 
 
 
247 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  45.79 
 
 
289 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  45.5 
 
 
277 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  45.5 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  41.56 
 
 
249 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  44.6 
 
 
253 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  44.29 
 
 
265 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  41.08 
 
 
249 aa  185  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  45.06 
 
 
262 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>