124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4086 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
216 aa  229  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
225 aa  226  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  53.02 
 
 
212 aa  222  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  54.5 
 
 
211 aa  222  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  51.94 
 
 
205 aa  201  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.21 
 
 
204 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.14 
 
 
202 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.8 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.5 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.98 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.49 
 
 
204 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  38.28 
 
 
198 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.1 
 
 
201 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.8 
 
 
205 aa  118  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.52 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.83 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.32 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.83 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.44 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  28.67 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 
187 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  25.2 
 
 
474 aa  45.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
185 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4255  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0371  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0457  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  25.2 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0370  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0382  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
308 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.84 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2998  orotate phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  28.69 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.67 
 
 
322 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0353  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90848  orotate phosphoribosyltransferase  22.75 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
315 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 
173 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
315 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
315 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.84 
 
 
316 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.84 
 
 
316 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.39 
 
 
315 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
315 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>