152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3764 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
376 aa  719    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  46.5 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  41.61 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  39.32 
 
 
341 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 
363 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  27.12 
 
 
346 aa  99.8  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  34.71 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  25.37 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.88 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  27.43 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  22.77 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  25.08 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  24.32 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  22.33 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.98 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  24.77 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  24.71 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.57 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  23.53 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.86 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  29.12 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  25.97 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.58 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  25.19 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.77 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  23.94 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.57 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.98 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  23.81 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  35.86 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  32.2 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  23.64 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  23.81 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.47 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  27.75 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 
345 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  32.23 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  23.82 
 
 
372 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  23.82 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.03 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.03 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  19.93 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.03 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  34.92 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.43 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  27.54 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 
425 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  31.62 
 
 
354 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  26.37 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  29.84 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  24.64 
 
 
353 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  30.77 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  23.94 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  25.95 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  22.83 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  30.94 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  21.58 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  30.68 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  30.25 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  33.9 
 
 
358 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  30.25 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  25.56 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  26.64 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  25.08 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.73 
 
 
373 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  23.93 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  33.87 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  34.45 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  33.07 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  32.2 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  31.15 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  21.83 
 
 
352 aa  54.3  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  28.67 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0794  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0479876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  28.44 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  32.12 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.7 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  30.25 
 
 
361 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  31.3 
 
 
363 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  25.32 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  30.33 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  32.56 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  25.99 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  27.19 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  30.51 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  26.28 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>