More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3372 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  46.86 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.45 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 		 350 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.83 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  29.41 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 		 350 aa  95.5  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.82 
 
 		 350 aa  95.5  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 355 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  30.09 
 
 		 350 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.12 
 
 		 325 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 347 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 384 aa  92  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  32.91 
 
 		 332 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  33.33 
 
 		 352 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.97 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.9 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 		 346 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.15 
 
 		 341 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.59 
 
 		 337 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.47 
 
 		 334 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.47 
 
 		 334 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.43 
 
 		 333 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  31.45 
 
 		 338 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  37.21 
 
 		 351 aa  85.5  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.72 
 
 		 330 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  30.06 
 
 		 355 aa  85.1  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.16 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.63 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.72 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  30.07 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  30.07 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.82 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  32.65 
 
 		 371 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  31.44 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  30.07 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  31.44 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.67 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.11 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.33 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.56 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.87 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  33.86 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  27.17 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  28 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.87 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  25.44 
 
 		 583 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  37.59 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.63 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.33 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  23.25 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.25 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.62 
 
 		 509 aa  72  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.86 
 
 		 356 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  26.5 
 
 		 335 aa  72  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.86 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.93 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.51 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 570 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.9 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.83 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  35.2 
 
 		 649 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  34.53 
 
 		 693 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31.01 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 662 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  35.14 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  37.41 
 
 		 667 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 606 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  30.54 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  35.17 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.87 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.26 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  33.62 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.5 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  33.06 
 
 		 648 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  29.2 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 659 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.86 
 
 		 671 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  31.36 
 
 		 583 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  29.2 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 661 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  29.2 
 
 		 369 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.61 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 		 364 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.11 
 
 		 347 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>