98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1656 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  922    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.16 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.8 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  23.81 
 
 		 918 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.16 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  27.8 
 
 		 785 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  24.64 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  25.5 
 
 		 516 aa  90.1  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  28.9 
 
 		 841 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 837 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 841 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  25.3 
 
 		 860 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  25 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  26.27 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  26.27 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  25 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  25.88 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.35 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  27.24 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  27.85 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  29.02 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  29.02 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  25.91 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  26.02 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  25.2 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  25.61 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  25.35 
 
 		 838 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  24.68 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  29.41 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  23.63 
 
 		 857 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  24.78 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  31.72 
 
 		 484 aa  67  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  27.57 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  23.94 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  22.02 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  26.87 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  27.52 
 
 		 619 aa  59.7  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  25.37 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.09 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  23.39 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.52 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  22.8 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  23.03 
 
 		 887 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  23.03 
 
 		 887 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  22.28 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  30.53 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  24.72 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  31.17 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  22.95 
 
 		 687 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  22.69 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  25.53 
 
 		 719 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  19.4 
 
 		 331 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.44 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.62 
 
 		 314 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.29 
 
 		 347 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3053  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.56 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.6 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.77 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  23.3 
 
 		 897 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  23.29 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  22.16 
 
 		 872 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  24.86 
 
 		 716 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.85 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  22.28 
 
 		 681 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.28 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3704  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.88 
 
 		 591 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.4 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.21 
 
 		 354 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  25.81 
 
 		 886 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.4 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.62 
 
 		 325 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  24.77 
 
 		 276 aa  43.5  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>