More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0566 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  65.39 
 
 
820 aa  964    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  56.56 
 
 
770 aa  810    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  100 
 
 
764 aa  1513    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  54.69 
 
 
786 aa  781    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  54.44 
 
 
745 aa  764    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  38.25 
 
 
792 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 
716 aa  339  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  33.92 
 
 
740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  31.31 
 
 
753 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  48.77 
 
 
732 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  56.51 
 
 
625 aa  321  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  45.03 
 
 
474 aa  320  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  44.84 
 
 
475 aa  304  5.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
473 aa  302  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  34.59 
 
 
725 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  31.99 
 
 
773 aa  296  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  39.79 
 
 
465 aa  281  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  42.63 
 
 
479 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  53.02 
 
 
604 aa  270  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 
641 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 
500 aa  188  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  31.49 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 
796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  30 
 
 
476 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.84 
 
 
489 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  30.95 
 
 
476 aa  170  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.82 
 
 
467 aa  170  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.54 
 
 
467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.54 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.54 
 
 
467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.2 
 
 
506 aa  164  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  29.07 
 
 
467 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.54 
 
 
467 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.85 
 
 
476 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.33 
 
 
467 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.33 
 
 
467 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  30.14 
 
 
471 aa  161  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 
482 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.54 
 
 
467 aa  161  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.79 
 
 
471 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  30.19 
 
 
469 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  29.86 
 
 
471 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 
465 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 
465 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 
471 aa  159  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.51 
 
 
483 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
481 aa  157  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
467 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 
495 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.83 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.83 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  29.83 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  29.83 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  30.07 
 
 
471 aa  156  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 
496 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 
494 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.83 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  29.83 
 
 
471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  32.17 
 
 
473 aa  154  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.31 
 
 
471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.57 
 
 
471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.31 
 
 
471 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 
456 aa  152  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 
466 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
490 aa  151  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 
494 aa  151  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 
488 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
496 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 
496 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  28.54 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 
468 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 
466 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 
468 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 
486 aa  150  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.87 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.71 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.71 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
495 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  29.71 
 
 
462 aa  148  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  28.33 
 
 
463 aa  148  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.25 
 
 
486 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.25 
 
 
486 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 
492 aa  147  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.96 
 
 
485 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 
500 aa  147  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 
488 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 
491 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.16 
 
 
471 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.16 
 
 
471 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.16 
 
 
471 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 
466 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.68 
 
 
471 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.46 
 
 
460 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  30.73 
 
 
500 aa  144  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 
464 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 
439 aa  144  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  27.92 
 
 
471 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>