More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0290 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  100 
 
 
341 aa  677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  85.44 
 
 
355 aa  548  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  69.16 
 
 
319 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  42.9 
 
 
309 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  46.3 
 
 
309 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
326 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.49 
 
 
335 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  46.52 
 
 
336 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  43.32 
 
 
318 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 
305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.61 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  42.49 
 
 
305 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  44.63 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  44.37 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  41.54 
 
 
316 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  41.85 
 
 
305 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  43.87 
 
 
310 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  45.33 
 
 
319 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
312 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
310 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  43.69 
 
 
321 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
310 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  45.17 
 
 
333 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  43.69 
 
 
321 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.23 
 
 
310 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  43.97 
 
 
310 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 
310 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.97 
 
 
310 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  45.28 
 
 
309 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  45.39 
 
 
308 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  45.07 
 
 
308 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  45.07 
 
 
308 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 
325 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  42.72 
 
 
307 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  54.78 
 
 
262 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  41.34 
 
 
320 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  42.72 
 
 
310 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  42.99 
 
 
308 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  41.14 
 
 
315 aa  237  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
308 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 
308 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  43.04 
 
 
310 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.37 
 
 
310 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  45.07 
 
 
308 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  42.99 
 
 
308 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 
343 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  45.22 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  42.99 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  41.64 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  40.63 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  43.97 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  42.81 
 
 
325 aa  236  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  42.07 
 
 
308 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  44.95 
 
 
309 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  41.23 
 
 
307 aa  235  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  51.8 
 
 
239 aa  235  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  42.5 
 
 
334 aa  235  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  51.42 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  43.97 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  43.62 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  44.74 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  41.89 
 
 
315 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  43.22 
 
 
326 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  46.91 
 
 
298 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  48.13 
 
 
310 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
304 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  50.67 
 
 
250 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  42.54 
 
 
306 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
304 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  42.31 
 
 
306 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  39.81 
 
 
307 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  43.4 
 
 
308 aa  232  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  43.81 
 
 
309 aa  232  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  42.77 
 
 
306 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
324 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
310 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  40.89 
 
 
308 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  43.79 
 
 
336 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 
313 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  42.16 
 
 
309 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  41.72 
 
 
308 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  42.17 
 
 
308 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
308 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  40.25 
 
 
319 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.91 
 
 
305 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  42.26 
 
 
310 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  41.31 
 
 
312 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  42.44 
 
 
319 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  42.44 
 
 
318 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 
308 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  41.1 
 
 
297 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  40.39 
 
 
321 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  41.99 
 
 
306 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>