56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15420 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  937    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  62.7 
 
 
455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  55.66 
 
 
452 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  55.73 
 
 
456 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  55.51 
 
 
456 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  54.36 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  49.22 
 
 
452 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  45.86 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  47.66 
 
 
452 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  38.67 
 
 
469 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  38.8 
 
 
464 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  37.89 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  34.3 
 
 
451 aa  299  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  37.14 
 
 
484 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  26.49 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  31.19 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  28.51 
 
 
461 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  27.41 
 
 
445 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  26.91 
 
 
452 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  28.51 
 
 
461 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  28.51 
 
 
461 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  28.24 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  25.95 
 
 
445 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  24.55 
 
 
607 aa  60.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  30.64 
 
 
452 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  32.14 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  27.6 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  31.82 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  25.87 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  26.34 
 
 
444 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  27.87 
 
 
445 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  27.19 
 
 
454 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  26.49 
 
 
450 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  26.59 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  22.85 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  25.75 
 
 
450 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  26.43 
 
 
482 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  22.85 
 
 
451 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  30.63 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  29.27 
 
 
454 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  28.25 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  28.9 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  28.41 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  25.17 
 
 
587 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  23.28 
 
 
608 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  24.54 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  27.56 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  23.87 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  27.39 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  26.41 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  22.91 
 
 
596 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  24.55 
 
 
600 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  24.15 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  24.9 
 
 
600 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  21.98 
 
 
603 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  27.22 
 
 
473 aa  43.9  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>