More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4620 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4620  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 
479 aa  961    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2124  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.47 
 
 
474 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0345179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0168  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.32 
 
 
462 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4223  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.38 
 
 
449 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168006  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2618  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.25 
 
 
453 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3956  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.69 
 
 
455 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2065  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.18 
 
 
557 aa  203  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0751  transcriptional regulator  37.3 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.894725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2763  transcriptional regulator ZraR  38.71 
 
 
445 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2825  transcriptional regulator ZraR  38.71 
 
 
445 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.479389  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2938  transcriptional regulator ZraR  38.71 
 
 
445 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2804  transcriptional regulatory protein ZraR  38.39 
 
 
445 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2707  sigma-54 dependent response regulator  38.06 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2707  sigma-54 dependent response regulator  38.06 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2839  sigma-54 dependent response regulator  38.06 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2721  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  38.39 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0608  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.88 
 
 
461 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0447  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.88 
 
 
461 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1516  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.79 
 
 
643 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0140  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.89 
 
 
500 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02446  predicted DNA-binding response regulator in two-component system  37.74 
 
 
444 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1114  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.74 
 
 
444 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.922386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02410  hypothetical protein  37.74 
 
 
444 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2919  sigma-54 dependent response regulator  37.74 
 
 
444 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1123  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.74 
 
 
444 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3788  sigma-54 dependent response regulator  37.74 
 
 
444 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  37.66 
 
 
589 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 
466 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0270  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.74 
 
 
598 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1807  two component Fis family transcriptional regulator  37.18 
 
 
440 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  38.33 
 
 
575 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.68 
 
 
445 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3573  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.28 
 
 
591 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2768  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.45 
 
 
445 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.38 
 
 
489 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.38 
 
 
489 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3308  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.67 
 
 
548 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.42 
 
 
454 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0659  Fis family transcriptional regulator  39.51 
 
 
476 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1394  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.86 
 
 
450 aa  192  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.205793  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.55 
 
 
458 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  36.92 
 
 
448 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1657  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.13 
 
 
459 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000574549  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3471  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.92 
 
 
489 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1222  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.89 
 
 
475 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3727  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.98 
 
 
653 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.368153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2047  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.02 
 
 
601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000649144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.31 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1000  helix-turn-helix, Fis-type  38.18 
 
 
661 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0620  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.67 
 
 
653 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.03 
 
 
451 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3630  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.2 
 
 
502 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.670707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.42 
 
 
448 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1685  two component Fis family transcriptional regulator  37.11 
 
 
457 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529377  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2642  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.18 
 
 
542 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2647  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.41 
 
 
467 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3049  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.98 
 
 
445 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1259  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3629  two-component system response regulator  35.96 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3052  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.18 
 
 
541 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3091  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.94 
 
 
456 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.416346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1152  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0185  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 
446 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0662  helix-turn-helix, Fis-type  36.08 
 
 
451 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3052  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.46 
 
 
476 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1989  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.05 
 
 
444 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2786  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 
477 aa  189  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.86 
 
 
470 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1226  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.66 
 
 
445 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  37.69 
 
 
486 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3651  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 
445 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.93 
 
 
502 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2807  response regulator transcription regulator protein  47.62 
 
 
570 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.524986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2494  response regulator receiver protein  38.93 
 
 
452 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  35.85 
 
 
492 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5133  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.93 
 
 
584 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0596409  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0337  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.61 
 
 
541 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.1 
 
 
756 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.83 
 
 
496 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  41.77 
 
 
472 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.1 
 
 
452 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6499  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 
458 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0349  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.07 
 
 
541 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 
458 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321079  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3376  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 
462 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 
500 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2187  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.3 
 
 
456 aa  186  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1692  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 
521 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.54 
 
 
469 aa  186  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358984  normal  0.379225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1746  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.58 
 
 
563 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.01 
 
 
466 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5548  helix-turn-helix, Fis-type  39.4 
 
 
658 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.34 
 
 
557 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0925  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 
484 aa  186  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.815173  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3082  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.19 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0747434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5407  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.93 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3032  NifA subfamily transcriptional regulator  45.18 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5854  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.54 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1160  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.83 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.76 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>