45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2123 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 587 aa  1152    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  43.11 
 
 		 680 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.53 
 
 		 680 aa  359  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.26 
 
 		 590 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.21 
 
 		 682 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.36 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.46 
 
 		 693 aa  317  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.01 
 
 		 659 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.76 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  40.21 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.5 
 
 		 609 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.54 
 
 		 674 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.43 
 
 		 1537 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  39.73 
 
 		 676 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.62 
 
 		 684 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.14 
 
 		 575 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.4 
 
 		 406 aa  207  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.62 
 
 		 627 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  31.47 
 
 		 706 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  31.11 
 
 		 666 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  41.67 
 
 		 232 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.88 
 
 		 830 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  28.23 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  28.7 
 
 		 651 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.39 
 
 		 404 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.57 
 
 		 824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.14 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  54.35 
 
 		 143 aa  94  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.02 
 
 		 1672 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.51 
 
 		 449 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  27.31 
 
 		 444 aa  87.4  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  27.09 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  30.62 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  34.71 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.2 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  23.32 
 
 		 692 aa  63.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  27.03 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  31.43 
 
 		 629 aa  54.3  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.57 
 
 		 2296 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  27.68 
 
 		 1538 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  25.68 
 
 		 1069 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2490  hypothetical protein  34.26 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  33.33 
 
 		 1672 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>