More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0483 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
368 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  38.12 
 
 
375 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  38.89 
 
 
375 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  38.12 
 
 
375 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  26.76 
 
 
695 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 
680 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
349 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
363 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
347 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  36.11 
 
 
359 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  36.11 
 
 
359 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  37.67 
 
 
362 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
361 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  37.91 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
359 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  28.07 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 
335 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  31.76 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  35.48 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  35.37 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
361 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  34.25 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  34.25 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  34.25 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 
694 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  34.25 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  33.78 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  34.25 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  33.78 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
385 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
337 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  33.56 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  34.48 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.61 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.63 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  33.57 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.43 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.27 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.82 
 
 
319 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  24.15 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.28 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  25.82 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  33.82 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.61 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  30.61 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>