More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3234 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  87.82 
 
 		 205 aa  352  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  88.5 
 
 		 200 aa  347  5e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  86.8 
 
 		 199 aa  347  7e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  79.31 
 
 		 203 aa  305  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  74.5 
 
 		 200 aa  301  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  74 
 
 		 200 aa  300  9e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  73.4 
 
 		 203 aa  288  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  45.92 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  45.6 
 
 		 348 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  45.83 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  43.37 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  46.07 
 
 		 437 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 304 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  41.12 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  41.67 
 
 		 304 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  41.67 
 
 		 304 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  43.68 
 
 		 269 aa  165  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  41.5 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  41.15 
 
 		 304 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  41.09 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  42.57 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  43.56 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  41.45 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  40.84 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  43 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  41.24 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  40.51 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  41.62 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  43.92 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  38.38 
 
 		 225 aa  157  7e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  39.59 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  42.35 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  39.69 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  40.93 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  39.09 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  38.89 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  40.1 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  40.51 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  40.1 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  42.21 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  41.5 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  37.76 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  41.8 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  38.89 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  38.89 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  42.03 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  38.89 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  42.5 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  40.1 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  44 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  42.08 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  40.91 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  40 
 
 		 299 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  39.58 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  40 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  39.18 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  42.29 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  40.59 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  40.1 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  42.86 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  42.16 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  40.53 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  40.2 
 
 		 209 aa  147  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  39.7 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  42.44 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  38.5 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  42.44 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  40.58 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  39.18 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  41.95 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  37.95 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  41.15 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  42.36 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  40.91 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  39.32 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  42.31 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  39.6 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  40.8 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  39.39 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  37.62 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  39.9 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  37.62 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>