More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0616 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0291  ABC-2 type transporter  61.54 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2134  ABC-2 type transporter  58.94 
 
 		 270 aa  289  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.92699  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  38.96 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  38.96 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  38.96 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  37.34 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.87 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  35.89 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  37.11 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  36.65 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  35.46 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  36.48 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  35.97 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  35.89 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  36.11 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  41.05 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  36.58 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  35.83 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.18 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  36.29 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.66 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  36.59 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  37.84 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  34.84 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  35.43 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  38.17 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  35.43 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  36.59 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03055  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  34.65 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  34.65 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  34.65 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  34.65 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.72 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  35.74 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  36.91 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>