70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1768 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  836    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  66.96 
 
 		 451 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  63.74 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 		 418 aa  395  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  23.11 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 398 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.1 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  29.52 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  24.29 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  22.29 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  28.65 
 
 		 579 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.49 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  27.22 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  30.43 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  30.43 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  30.43 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  30.43 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.6 
 
 		 539 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>