69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1142 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1142  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  770    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.313473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1216  integrase family protein  30.38 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000753673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3592  integrase family protein  26.18 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2505  integrase family protein  24.64 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1808  integrase family protein  24.49 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0154  integrase domain protein SAM domain protein  30.89 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32279  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.58 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  21.58 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2247  site-specific recombinase  24.17 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0011212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  21.6 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.26 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  27.32 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  22.73 
 
 		 288 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  26.6 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  23.1 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  23.47 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  23.9 
 
 		 306 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  21.89 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.54 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  23.37 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.8 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.53 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  24.91 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  20.26 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.8 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  21.89 
 
 		 294 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.23 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  27.42 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  23.57 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  24.37 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  24.14 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  21.59 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  28.38 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  28.38 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  23.75 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  28.38 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.15 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.09 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.1 
 
 		 300 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  22.92 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.73 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.9 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.73 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  21.03 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  22.76 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  22.42 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  22.05 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>