More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0789 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 330 aa  666    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.29 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.24 
 
 		 328 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.7 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  31.08 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  31.85 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  31.73 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  31.23 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  29.78 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  28.47 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  31.37 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  31.37 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  28.47 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  31.23 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  31.37 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.42 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.49 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.35 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 310 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.82 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.89 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.03 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.92 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  24.69 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  27.05 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  24 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  23.36 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.81 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.78 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.11 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  24.59 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.95 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.08 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.78 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  27.63 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.62 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.94 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.78 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.63 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.47 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.99 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.73 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  31.02 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  29.57 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.72 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.71 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.24 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  29.57 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  29.57 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.51 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  30.11 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.98 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.68 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.7 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.46 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 694 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  29.03 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  29.03 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.46 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  30.48 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  29.57 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.65 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.38 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  26.02 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>