More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0643 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.07 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.17 
 
 
294 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  42.54 
 
 
286 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  47.76 
 
 
296 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.13 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.82 
 
 
291 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.06 
 
 
283 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.45 
 
 
291 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.45 
 
 
291 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.33 
 
 
288 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  48.34 
 
 
291 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.41 
 
 
280 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.65 
 
 
462 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  44.28 
 
 
288 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.97 
 
 
291 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  44 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.48 
 
 
296 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.93 
 
 
287 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.59 
 
 
292 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  35.07 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  34.7 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  38.21 
 
 
294 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  35.61 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  35.54 
 
 
295 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  33.68 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  33.21 
 
 
308 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  41.25 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 
322 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.09 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.99 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.25 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  32 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.95 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  28.36 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  29.3 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  28.36 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  26.51 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.91 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  26.77 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.12 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  27.45 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  28.69 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.31 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  28.25 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  26.1 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  25.82 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.4 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.48 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.74 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  28.31 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0001  hypothetical protein  33.54 
 
 
353 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.50986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.92 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
252 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  27.09 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  34.5 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  26.5 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  25.79 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.49 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  25.4 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  25.79 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  29.89 
 
 
370 aa  65.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>