24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5107 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  100 
 
 
991 aa  1975    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  30.95 
 
 
969 aa  210  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  30.06 
 
 
976 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  28.85 
 
 
876 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.83 
 
 
830 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  28.53 
 
 
425 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  26.87 
 
 
728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  25.87 
 
 
832 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  27.65 
 
 
765 aa  109  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.57 
 
 
832 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.06 
 
 
833 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  26.26 
 
 
737 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.52 
 
 
719 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.86 
 
 
792 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.83 
 
 
841 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  23.7 
 
 
1276 aa  84.7  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  24.71 
 
 
1009 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  25.32 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  26.35 
 
 
742 aa  75.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  22.98 
 
 
751 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  24.58 
 
 
906 aa  68.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  23.36 
 
 
811 aa  55.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  52  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  22.68 
 
 
747 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>