More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1568 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 330 aa  673    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.81 
 
 		 375 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  40.58 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.22 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.62 
 
 		 381 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.83 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.69 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.95 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.61 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.9 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  37.01 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  38.08 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.89 
 
 		 382 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  37.42 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.25 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.44 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.58 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.99 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.51 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.12 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.51 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33.54 
 
 		 404 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.82 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.86 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  33.65 
 
 		 405 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  31.63 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  36.09 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  32.49 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  33.22 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.33 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  34.09 
 
 		 394 aa  146  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  34.8 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.06 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.8 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  33.55 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  30.65 
 
 		 414 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  34.3 
 
 		 414 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  32.39 
 
 		 441 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.12 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  30.86 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.96 
 
 		 405 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31 
 
 		 437 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  31.15 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.75 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.85 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  31.49 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.8 
 
 		 422 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  33.44 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.65 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.37 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.11 
 
 		 419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  31.83 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  31.19 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  31.92 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  29.79 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  30.25 
 
 		 434 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  30.09 
 
 		 454 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  28.09 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  30.5 
 
 		 422 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.85 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.02 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  27.95 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  29.41 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  29.41 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  30.79 
 
 		 347 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.78 
 
 		 388 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  29.62 
 
 		 439 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  33.12 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  29.25 
 
 		 368 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  28.66 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  28.48 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  29.25 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  35.46 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  34.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  30.67 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  30 
 
 		 425 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  31.96 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  33.85 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  30.67 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  30.35 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  31.71 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  33.33 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.99 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  31.61 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  29.17 
 
 		 421 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1241  threonine synthase  33.23 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000161931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  32.3 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.74 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  32.62 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  32.18 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  34.81 
 
 		 353 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  31.35 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  32.19 
 
 		 402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  33.97 
 
 		 413 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  29.97 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  29.06 
 
 		 419 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  34.71 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1395  threonine synthase  31.56 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  31.03 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  29.75 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>