More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0452 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0452  integral membrane protein MviN  100 
 
 
526 aa  1036    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  42.29 
 
 
517 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  43.13 
 
 
528 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  46.7 
 
 
519 aa  296  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 
534 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.03 
 
 
511 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  31.61 
 
 
523 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  32.43 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
531 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.08 
 
 
511 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 
511 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  32.9 
 
 
524 aa  157  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.77 
 
 
521 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 
521 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  31.92 
 
 
538 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.78 
 
 
521 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  34.78 
 
 
521 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 
519 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  32.98 
 
 
526 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.63 
 
 
521 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.46 
 
 
522 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
549 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 
519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 
519 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  31.47 
 
 
513 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
519 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
519 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  31.61 
 
 
536 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
519 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  32 
 
 
536 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29 
 
 
521 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 
519 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.03 
 
 
522 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 
519 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  28.24 
 
 
521 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.25 
 
 
528 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
526 aa  144  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30 
 
 
513 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 
512 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  29.27 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  29.95 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
511 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
542 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  32.52 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 
512 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  29.26 
 
 
521 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
519 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 
511 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 
613 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  25.5 
 
 
521 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  29.43 
 
 
512 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 
519 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 
511 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  28.32 
 
 
524 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 
519 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  31.84 
 
 
514 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  29.7 
 
 
512 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  27.73 
 
 
519 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  28.42 
 
 
520 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  30.67 
 
 
513 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 
523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  28.29 
 
 
516 aa  137  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  30.2 
 
 
522 aa  137  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 
512 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  28.87 
 
 
511 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  28.36 
 
 
532 aa  136  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.69 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  26.04 
 
 
522 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  27.8 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  28.2 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  27.89 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 
527 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  24.59 
 
 
516 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 
534 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  26.92 
 
 
519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.63 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  28.57 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  30.21 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
524 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
524 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  26.44 
 
 
505 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
524 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
530 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
524 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
524 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 
545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  26.77 
 
 
516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  29.16 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  24.43 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>