More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0378 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 586 aa  1191    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  36.24 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  36.89 
 
 		 636 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.67 
 
 		 647 aa  349  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 		 645 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 		 639 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 643 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 642 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.51 
 
 		 619 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 646 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.27 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  32.98 
 
 		 640 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 639 aa  297  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 634 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 628 aa  292  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  30.9 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 		 648 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 		 646 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 633 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 		 643 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  30.38 
 
 		 638 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.86 
 
 		 646 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 648 aa  287  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 		 640 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 		 646 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 		 631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 		 648 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  30.2 
 
 		 647 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 		 648 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 		 649 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 		 671 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.73 
 
 		 629 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.82 
 
 		 641 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 631 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 630 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 		 681 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 629 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 		 629 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.59 
 
 		 629 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 602 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 647 aa  278  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 		 630 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 636 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 		 634 aa  276  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  30.44 
 
 		 634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 602 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  31.1 
 
 		 612 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 602 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 618 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  31.1 
 
 		 615 aa  273  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 618 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 		 618 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.51 
 
 		 618 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 		 631 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  29.85 
 
 		 637 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 		 634 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1182  penicillin-binding protein 2  32.44 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  29.59 
 
 		 628 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  30.7 
 
 		 636 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 		 631 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  30.7 
 
 		 636 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 		 617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 		 673 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 		 624 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 664 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 		 631 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 		 611 aa  270  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  29.36 
 
 		 650 aa  269  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 637 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  29.71 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.69 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 678 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 633 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  30.38 
 
 		 627 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  29.53 
 
 		 623 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 767 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.12 
 
 		 691 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 636 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  29.27 
 
 		 771 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 		 601 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 689 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  29.53 
 
 		 623 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.74 
 
 		 802 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 629 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 618 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 618 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  29 
 
 		 631 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  29.53 
 
 		 623 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.18 
 
 		 618 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  29.79 
 
 		 803 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  29.72 
 
 		 630 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  29.53 
 
 		 623 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 		 618 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>