More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0271 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0271  ribosomal protein S3  100 
 
 		 231 aa  460  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0285  ribosomal protein S3  66.07 
 
 		 227 aa  318  5e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 213 aa  258  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 213 aa  252  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  50.42 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 210 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 220 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 210 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  53.27 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 213 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 211 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 211 aa  245  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  48.88 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 212 aa  245  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  51.16 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  51.42 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1298  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000309982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 237 aa  241  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1388  ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000147374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  48.03 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  47.98 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  52.7 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 229 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 221 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  50.95 
 
 		 210 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  48.47 
 
 		 230 aa  237  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  49.52 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  47.71 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  49.52 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  47.25 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 238 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 238 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  48.03 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  48.03 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  48.03 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 220 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0297  ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.888515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  48.03 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  52.15 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 251 aa  234  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  50 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  48.57 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0784  ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 210 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  50.23 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  47.69 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>