102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4696 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1222    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 498 aa  95.5  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  45 
 
 		 535 aa  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  50 
 
 		 508 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  50 
 
 		 508 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  50 
 
 		 508 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  50 
 
 		 508 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  50 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  50 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  49.5 
 
 		 546 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  48 
 
 		 582 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  47 
 
 		 532 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  47 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  46 
 
 		 571 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  47 
 
 		 601 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  46 
 
 		 601 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  47.25 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  46 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  50.63 
 
 		 620 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  45.26 
 
 		 550 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  44.76 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  44.76 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  46.81 
 
 		 581 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  46.81 
 
 		 581 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  43.33 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  46.81 
 
 		 593 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  46.81 
 
 		 593 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  46.81 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.76 
 
 		 578 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  45.74 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  44.68 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  44.44 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  32.3 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  45.16 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  45.16 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  41.49 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  44.21 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  44.21 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  44.57 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  44.57 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  44.57 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  45.74 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  44.68 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  45.74 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  42.86 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  41.24 
 
 		 530 aa  63.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  37.58 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  42.55 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  44.21 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  39.77 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  44.78 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  46.32 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.19 
 
 		 620 aa  57  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  44.09 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  40.22 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  43.06 
 
 		 521 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  42.31 
 
 		 568 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  43.04 
 
 		 628 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  31.38 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  42.17 
 
 		 743 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  36.17 
 
 		 499 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  45.59 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  37.63 
 
 		 547 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  35.57 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.61 
 
 		 535 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 432 aa  50.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 584 aa  50.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  37.5 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 198 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 558 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  35.87 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  40.24 
 
 		 457 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  39.33 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 117 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  48 
 
 		 131 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 516 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  27.39 
 
 		 404 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  34.69 
 
 		 566 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  27.35 
 
 		 403 aa  47.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  38.61 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  34.95 
 
 		 572 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  38.14 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.89 
 
 		 512 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  27.56 
 
 		 405 aa  45.8  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  27.35 
 
 		 405 aa  45.8  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  37.63 
 
 		 485 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  39.08 
 
 		 434 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  39.08 
 
 		 434 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  33.98 
 
 		 557 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  40.24 
 
 		 441 aa  44.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  26.99 
 
 		 437 aa  44.3  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>