71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3616 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  100 
 
 		 131 aa  266  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  56.49 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  52.38 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  56.36 
 
 		 427 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 748 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45 
 
 		 581 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45 
 
 		 581 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  45 
 
 		 578 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  45 
 
 		 578 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  45 
 
 		 578 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  48.28 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  48.28 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  48.28 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  43.33 
 
 		 578 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  48.15 
 
 		 512 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  46.67 
 
 		 593 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  46.67 
 
 		 593 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  45 
 
 		 519 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  45 
 
 		 524 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  43.33 
 
 		 535 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  44.44 
 
 		 539 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  39.76 
 
 		 443 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  46.3 
 
 		 550 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 567 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  49.09 
 
 		 550 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  47.27 
 
 		 519 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 426 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  43.1 
 
 		 582 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.67 
 
 		 517 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  48 
 
 		 508 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  48 
 
 		 508 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  46 
 
 		 508 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  46 
 
 		 508 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 532 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  46 
 
 		 491 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  46 
 
 		 514 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  46 
 
 		 516 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 709 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  46 
 
 		 491 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  46 
 
 		 491 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 620 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  44 
 
 		 601 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  48 
 
 		 635 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 443 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  39.44 
 
 		 571 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  41.94 
 
 		 593 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  38.55 
 
 		 601 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  44.83 
 
 		 488 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  44.83 
 
 		 511 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  37.7 
 
 		 461 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2026  hypothetical protein  39.34 
 
 		 455 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4974  hypothetical protein  44.23 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 743 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  41.38 
 
 		 441 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  40 
 
 		 512 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 628 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 535 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 620 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 585 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  38.24 
 
 		 620 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  40.24 
 
 		 551 aa  42  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 519 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  38 
 
 		 506 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  43.86 
 
 		 556 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  38.03 
 
 		 586 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3573  hypothetical protein  36.76 
 
 		 563 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 566 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 566 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 516 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>