259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4292 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4292  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
284 aa  553  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  30.94 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.92 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
232 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  27.88 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
496 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  20.85 
 
 
597 aa  63.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  25.31 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
410 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
606 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  27.09 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.63 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
378 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
460 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  28.69 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2624  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.99 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  29.29 
 
 
425 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
409 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
415 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  34.41 
 
 
442 aa  59.7  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2710  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  29.21 
 
 
574 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  29.58 
 
 
435 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2805  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
411 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
613 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
422 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
416 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  28.38 
 
 
389 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.3 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
1268 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  21.56 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1816  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.61786  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
443 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
424 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
421 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
421 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
421 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1239  cell wall membrane glycosyltransferase  30.53 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
514 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.54 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
386 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6102  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.57 
 
 
271 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266728  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.79 
 
 
402 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  34.41 
 
 
310 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
437 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
239 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  29.74 
 
 
348 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.81 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.9 
 
 
1099 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1270  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
514 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  37.89 
 
 
354 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>