More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4147 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 286 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  57.45 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3642  HemK family modification methylase  58.05 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4024  HemK family modification methylase  56.57 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2102  modification methylase, HemK family  52.13 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0088252  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1306  modification methylase HemK family  53.96 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  55.59 
 
 		 338 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29650  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.38 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1206  modification methylase, HemK family  53.33 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  53.85 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1752  HemK family modification methylase  51.03 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  51.6 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.53 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.35 
 
 		 314 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2458  modification methylase, HemK family  54.04 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  52.14 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  52.67 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  52.94 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  53.17 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  52.96 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  52.22 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  49.32 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.57 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1011  HemK family modification methylase  50.52 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11327  hypothetical protein  45.86 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4338  HemK family modification methylase  50 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  47.43 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  47.43 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  47.43 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.85 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2618  HemK family modification methylase  50.18 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0315341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  49.63 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  49.83 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  43.58 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1784  modification methylase, HemK family  45.18 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.483415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19230  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.39 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1062  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.5 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  43.9 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  41.11 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  43.15 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  39.51 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  35.52 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.72 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.01 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  42.49 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  36.77 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  39.8 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  43.77 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  38.44 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  40.94 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.67 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  41.79 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  40.77 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  42.11 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.79 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.59 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.63 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3491  modification methylase, HemK family  36.67 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  41.48 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  41.28 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  40.74 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.91 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  39.58 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  35.11 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.91 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.29 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.32 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  41.05 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  39.15 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  40.37 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  38.43 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  36.79 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.33 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  39.29 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.32 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.19 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.26 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.24 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.65 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.2 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  28.62 
 
 		 361 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  39.3 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  41.97 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  41.97 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40.97 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.81 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  32.33 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  35.48 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  37.74 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1484  modification methylase HemK  36.07 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0332487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  41.91 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.58 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  40.58 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  38.75 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  41.61 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.22 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  40.15 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>