219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3453 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  76.43 
 
 
159 aa  242  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  75.64 
 
 
163 aa  239  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  75.5 
 
 
153 aa  236  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  71.79 
 
 
163 aa  228  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  69.87 
 
 
159 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  69.87 
 
 
159 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  69.87 
 
 
159 aa  226  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  70.7 
 
 
159 aa  223  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.15 
 
 
163 aa  219  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  69.28 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.32 
 
 
159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.03 
 
 
164 aa  213  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  66.44 
 
 
163 aa  209  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.67 
 
 
165 aa  193  9e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.62 
 
 
163 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.54 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.89 
 
 
163 aa  96.3  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  50.48 
 
 
141 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40 
 
 
158 aa  94  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.07 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.23 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.61 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.82 
 
 
240 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.95 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.55 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.77 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.16 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.38 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.66 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.12 
 
 
174 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.12 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.42 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.53 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.31 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.18 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.13 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  35.77 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.91 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  32.71 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.56 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  32.43 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  35.82 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.86 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  39.78 
 
 
564 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.88 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.04 
 
 
141 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.3 
 
 
223 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  40.43 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.54 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.06 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  33.33 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.08 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30 
 
 
194 aa  58.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.02 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.77 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.54 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.3 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.27 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.82 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.21 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  34.35 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.58 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  31.54 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.73 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.07 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.47 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.82 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  30.13 
 
 
298 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.88 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  32.71 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.51 
 
 
521 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37349  predicted protein  35.22 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00419932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.08 
 
 
152 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  33.33 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.98 
 
 
155 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  36.89 
 
 
158 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  32.67 
 
 
182 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.62 
 
 
152 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.11 
 
 
147 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1534  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.63 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.88198  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.64 
 
 
158 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.93 
 
 
214 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.33 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.98 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  25.56 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40 
 
 
175 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  33.33 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.91 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.73 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.95 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  35 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>