122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1534 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1534  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.88198  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3110  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.72 
 
 
186 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.927067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2452  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.06 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0209474  normal  0.0162871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0310  putative cytosine/adenosine deaminase  32.76 
 
 
221 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.6846099999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.54 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.68 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.63 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.12 
 
 
186 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.2 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3003  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.91 
 
 
168 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.64 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.13 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  37.89 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  30.09 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.01 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  28.57 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.57 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  29.55 
 
 
240 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.94 
 
 
524 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0999  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.8 
 
 
147 aa  48.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.645759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
223 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  31.31 
 
 
163 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  34.78 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  31.48 
 
 
165 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  29.63 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.04 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  30.36 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.23 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.55 
 
 
159 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.07 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.65 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  33.65 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.63 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.08 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  30.53 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.3 
 
 
160 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.04 
 
 
151 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.55 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  34.48 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  35.64 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.73 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.49 
 
 
521 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  30 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  35.87 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.92 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  26.23 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.07 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.59 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.97 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.22 
 
 
141 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.12 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.55 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  30 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.06 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
152 aa  44.7  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.79 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  34.62 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  26.21 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  31.52 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  30.85 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.05 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.21 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.36 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.62 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.68 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.23 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.52 
 
 
143 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.08 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  27.62 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  30.34 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  29 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  30.85 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  27.35 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  34.23 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.97 
 
 
361 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.53 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.9 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.38 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.72 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.97 
 
 
361 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.95 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  24.76 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  30.91 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.2 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.7 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  25.77 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00550  tRNA specific adenosine deaminase, putative  34.74 
 
 
239 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00012286  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0085  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.56 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.9 
 
 
153 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.76 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  32.61 
 
 
158 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.82 
 
 
156 aa  42  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>