More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4829 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
160 aa  309  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  72.67 
 
 
150 aa  204  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  66 
 
 
168 aa  194  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  69.63 
 
 
154 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  62.82 
 
 
176 aa  173  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  62.16 
 
 
144 aa  173  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  67.11 
 
 
152 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  65.22 
 
 
154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  64.86 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56 
 
 
157 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.34 
 
 
158 aa  160  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.72 
 
 
144 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.6 
 
 
176 aa  156  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  73.83 
 
 
153 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  60.26 
 
 
167 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.83 
 
 
165 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  57.33 
 
 
147 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  66.44 
 
 
147 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.06 
 
 
190 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  51.32 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  49.37 
 
 
153 aa  151  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.35 
 
 
154 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.05 
 
 
159 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.43 
 
 
154 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.78 
 
 
156 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.7 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.09 
 
 
149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.7 
 
 
144 aa  143  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.22 
 
 
168 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.08 
 
 
150 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  53.06 
 
 
171 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.35 
 
 
151 aa  140  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  50.34 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.2 
 
 
144 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  54.73 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.46 
 
 
166 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.5 
 
 
160 aa  136  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.35 
 
 
158 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.05 
 
 
183 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.89 
 
 
154 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  65.32 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.71 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.98 
 
 
363 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.03 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.65 
 
 
164 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.94 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.36 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.3 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.39 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.83 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  51.33 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  50 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0310  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.14 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.3 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
152 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
175 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  50 
 
 
153 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  56.12 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  44.08 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  45.33 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.27 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.24 
 
 
190 aa  131  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.33 
 
 
154 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.71 
 
 
155 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  44.59 
 
 
159 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.16 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.05 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.27 
 
 
143 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.65 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.27 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  47.3 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.24 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  45.14 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  44.59 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  59.68 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.65 
 
 
164 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
160 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.52 
 
 
156 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.73 
 
 
475 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
148 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.52 
 
 
156 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.67 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.79 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.97 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2714  tRNA-adenosine deaminase  52.71 
 
 
196 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227671  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5341  tRNA-adenosine deaminase  61.19 
 
 
150 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5048  tRNA-adenosine deaminase  61.19 
 
 
150 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4960  tRNA-adenosine deaminase  61.19 
 
 
150 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.52 
 
 
194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0171  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.41 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  46.62 
 
 
222 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>