More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0171 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0171  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
160 aa  311  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  84.13 
 
 
147 aa  205  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  76.6 
 
 
149 aa  204  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  78.91 
 
 
166 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  68.57 
 
 
144 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  69.29 
 
 
144 aa  190  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  74.4 
 
 
154 aa  185  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  68.79 
 
 
153 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.02 
 
 
165 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  80 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5341  tRNA-adenosine deaminase  82.54 
 
 
150 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5048  tRNA-adenosine deaminase  82.54 
 
 
150 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4960  tRNA-adenosine deaminase  82.54 
 
 
150 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  66.92 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0310  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  72.58 
 
 
143 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  63.77 
 
 
167 aa  167  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  62.86 
 
 
144 aa  166  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.7 
 
 
168 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.71 
 
 
158 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  65.56 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.63 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.52 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  65.62 
 
 
176 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  70.43 
 
 
147 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  64 
 
 
176 aa  157  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  65.65 
 
 
143 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  63.16 
 
 
168 aa  154  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.19 
 
 
190 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
157 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.9 
 
 
176 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.14 
 
 
154 aa  148  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.27 
 
 
185 aa  147  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  53.38 
 
 
171 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2714  tRNA-adenosine deaminase  50.34 
 
 
196 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227671  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.15 
 
 
144 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  50.34 
 
 
149 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  58.04 
 
 
150 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.32 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.12 
 
 
154 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.7 
 
 
158 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.39 
 
 
152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  65.83 
 
 
162 aa  136  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.82 
 
 
160 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.14 
 
 
154 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  50.36 
 
 
172 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
152 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.79 
 
 
155 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  46.53 
 
 
153 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.59 
 
 
166 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.97 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  47.62 
 
 
153 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.38 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.99 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.25 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  49.01 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  50 
 
 
153 aa  132  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  48.95 
 
 
155 aa  131  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  52.38 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.75 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.14 
 
 
475 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  48.98 
 
 
150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.2 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26030  tRNA-adenosine deaminase  57.05 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.2 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.77 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.86 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.38 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  49.32 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
166 aa  127  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.15 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.77 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.78 
 
 
150 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  53.96 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.37 
 
 
151 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  47.3 
 
 
177 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.96 
 
 
154 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.36 
 
 
164 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.91 
 
 
165 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.49 
 
 
162 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.24 
 
 
183 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.21 
 
 
181 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  46.43 
 
 
161 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 
160 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.55 
 
 
148 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  50.78 
 
 
146 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.85 
 
 
147 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.2 
 
 
484 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  48.91 
 
 
166 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  44.44 
 
 
170 aa  120  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  48.91 
 
 
166 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  45.89 
 
 
151 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  47.52 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  48.46 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.44 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  48.46 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.35 
 
 
363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.36 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>