More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0310 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0310  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.34 
 
 
149 aa  200  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  67.83 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.73 
 
 
166 aa  191  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  67.86 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  67.42 
 
 
147 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5048  tRNA-adenosine deaminase  72.73 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4960  tRNA-adenosine deaminase  72.73 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5341  tRNA-adenosine deaminase  72.73 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  70.09 
 
 
152 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.57 
 
 
154 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  61.11 
 
 
144 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0171  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.8 
 
 
160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.16 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.63 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.08 
 
 
159 aa  161  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.94 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.83 
 
 
158 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  55.81 
 
 
149 aa  155  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  60.42 
 
 
143 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.91 
 
 
154 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  59.69 
 
 
176 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
157 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  56.64 
 
 
150 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  55.97 
 
 
168 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  51.82 
 
 
167 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.94 
 
 
152 aa  140  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  54.86 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.01 
 
 
176 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  57.26 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.79 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.84 
 
 
155 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  49.31 
 
 
155 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  46.53 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.46 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.91 
 
 
185 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.33 
 
 
154 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.09 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.94 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2714  tRNA-adenosine deaminase  53.85 
 
 
196 aa  131  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227671  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.36 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26030  tRNA-adenosine deaminase  57.36 
 
 
159 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  63.33 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.53 
 
 
152 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  45.14 
 
 
153 aa  130  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.72 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.92 
 
 
166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.77 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12760  tRNA-adenosine deaminase  49.67 
 
 
206 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255164  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.74 
 
 
152 aa  127  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.22 
 
 
176 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.36 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  45.83 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  46.53 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.71 
 
 
150 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.99 
 
 
190 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.92 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.14 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  45.14 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  47.22 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  50.71 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.49 
 
 
151 aa  124  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.45 
 
 
165 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.71 
 
 
183 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.61 
 
 
148 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  43.75 
 
 
151 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  43.45 
 
 
165 aa  124  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.04 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  43.75 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0650  tRNA-adenosine deaminase  53.49 
 
 
159 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  43.75 
 
 
159 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.74 
 
 
168 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  47.33 
 
 
172 aa  123  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  47.92 
 
 
177 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.14 
 
 
165 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  48.06 
 
 
153 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  46.03 
 
 
170 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.77 
 
 
147 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.32 
 
 
151 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
177 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.74 
 
 
166 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.22 
 
 
151 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 
152 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.16 
 
 
167 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  50.78 
 
 
151 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  48.06 
 
 
146 aa  120  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.12 
 
 
181 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.28 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  46.76 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.28 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.55 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  47.29 
 
 
168 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.74 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>