More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13784 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
152 aa  292  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  85.14 
 
 
149 aa  244  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5341  tRNA-adenosine deaminase  88.67 
 
 
150 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4960  tRNA-adenosine deaminase  88.67 
 
 
150 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5048  tRNA-adenosine deaminase  88.67 
 
 
150 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  81.33 
 
 
166 aa  230  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  75.34 
 
 
147 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  69.29 
 
 
144 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.03 
 
 
165 aa  184  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  72.87 
 
 
154 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  68.57 
 
 
144 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  73.6 
 
 
153 aa  179  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0171  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  77.78 
 
 
160 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  65.33 
 
 
143 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0310  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  68.75 
 
 
143 aa  167  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  68.46 
 
 
154 aa  167  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  68.22 
 
 
144 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  67.44 
 
 
168 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  67.76 
 
 
152 aa  164  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.51 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  67.44 
 
 
176 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  72.07 
 
 
185 aa  153  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.77 
 
 
158 aa  153  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  53.33 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  58.39 
 
 
167 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.29 
 
 
157 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  60.45 
 
 
168 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.78 
 
 
154 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  65.55 
 
 
147 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  62.02 
 
 
176 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.58 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  55.41 
 
 
168 aa  144  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  59.18 
 
 
150 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.12 
 
 
168 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2714  tRNA-adenosine deaminase  55.86 
 
 
196 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227671  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.89 
 
 
144 aa  140  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.47 
 
 
166 aa  140  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.86 
 
 
151 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.04 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.67 
 
 
174 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.67 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  62.71 
 
 
190 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.02 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  51.47 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  48.28 
 
 
158 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.05 
 
 
160 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.7 
 
 
166 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
154 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.33 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.24 
 
 
155 aa  134  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  48.99 
 
 
151 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.52 
 
 
147 aa  134  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  47.68 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.67 
 
 
165 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.33 
 
 
152 aa  133  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.85 
 
 
157 aa  133  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.68 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.03 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.94 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.25 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  47.69 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  48.99 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  48.99 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  54.35 
 
 
171 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.17 
 
 
166 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  54.17 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.32 
 
 
177 aa  130  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.46 
 
 
152 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.06 
 
 
181 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.71 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.38 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  46.15 
 
 
153 aa  130  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.97 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.9 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.47 
 
 
183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.36 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  44.22 
 
 
170 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.68 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.36 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
156 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  47.59 
 
 
161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.54 
 
 
187 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  47.68 
 
 
165 aa  127  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  53.49 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.02 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  49.33 
 
 
165 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.01 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  52.71 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  55.81 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  51.08 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.37 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  63.79 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.33 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  48.34 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.3 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26030  tRNA-adenosine deaminase  58.46 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  47.3 
 
 
222 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>