More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3258 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 243 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  64.22 
 
 		 234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  58.12 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  58.62 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  62.39 
 
 		 228 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  58.08 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  58.08 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  58.08 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  56.89 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  54.55 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  55.46 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  56.39 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  57.71 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  53.54 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  57.51 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  58.12 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  49.15 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  50 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  49.78 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.03 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  47.37 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  44.74 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  51.18 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  50.42 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  55.07 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  51.95 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  47.25 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  49.79 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  42.92 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.25 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  45.06 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  43.75 
 
 		 283 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  42.98 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  42.98 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  42.98 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  43.1 
 
 		 229 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  42.67 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  44.3 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  39.36 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  42.67 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  42.31 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  38.65 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  41.88 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.03 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  44.87 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  38.65 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  39.74 
 
 		 242 aa  141  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  41.63 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  33.63 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  40.52 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  41.63 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  38.93 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  37.94 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  41.63 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  36.93 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  42.37 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.13 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.13 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  37.39 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.13 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  40.52 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.13 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.13 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  37.95 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  41.2 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  38.77 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  39.13 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  42.06 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  40.52 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  37.34 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  40.87 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  44.14 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.59 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.06 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  43.59 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  44.98 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  37.55 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.63 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  34.33 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  34.33 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  37.18 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  44.53 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  40.25 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  37.18 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  37.3 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  39.75 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  45.3 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  37.99 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  39.33 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  39.48 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>