More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1528 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  100 
 
 
243 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  61.36 
 
 
227 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  60.55 
 
 
226 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  60.27 
 
 
226 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  53.85 
 
 
226 aa  255  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  61.47 
 
 
226 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  57.66 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  59.17 
 
 
224 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  54.95 
 
 
231 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  58.11 
 
 
231 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
224 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  50.94 
 
 
221 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  59.62 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  59.62 
 
 
232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  59.15 
 
 
232 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  56.31 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  55.8 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  48.17 
 
 
226 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  56.19 
 
 
230 aa  207  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  56.31 
 
 
230 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  45.23 
 
 
254 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  56.13 
 
 
246 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  41.33 
 
 
272 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  50.49 
 
 
256 aa  188  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.15 
 
 
277 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  50.23 
 
 
248 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  45.33 
 
 
222 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  44.95 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
299 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  39.66 
 
 
278 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  46.33 
 
 
226 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  46.4 
 
 
276 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
228 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.22 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  41.85 
 
 
277 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  41.96 
 
 
273 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  41.96 
 
 
273 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  46.19 
 
 
224 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  41.38 
 
 
281 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  48.08 
 
 
266 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 
281 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  40.49 
 
 
303 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  52.91 
 
 
245 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
395 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  45.81 
 
 
252 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.84 
 
 
398 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.7 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  42.11 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  38.57 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
277 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
277 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  43.05 
 
 
277 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.99 
 
 
310 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  43.24 
 
 
269 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
254 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
274 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  36.89 
 
 
283 aa  158  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  43.3 
 
 
238 aa  158  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
249 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
253 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  39.17 
 
 
628 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
258 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
269 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 
271 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  45.85 
 
 
272 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.64 
 
 
276 aa  155  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
402 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  38.2 
 
 
605 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.82 
 
 
243 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  36.73 
 
 
283 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  43.38 
 
 
232 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 
267 aa  153  2e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  36.73 
 
 
283 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  38.46 
 
 
269 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  35.98 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 
403 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  39.64 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
300 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  34.22 
 
 
275 aa  152  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
234 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 
280 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 
280 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
246 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 
242 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 
285 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
281 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 
266 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.47 
 
 
278 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  37.23 
 
 
288 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.49 
 
 
280 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.49 
 
 
280 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 
283 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  50.56 
 
 
243 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>