60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1286 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1286  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 318 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 1033 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  43.02 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.96 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  45.12 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  41.57 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  46.97 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  38.14 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  38.14 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  33.87 
 
 		 184 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 		 162 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  31.08 
 
 		 447 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  30.47 
 
 		 497 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  35.38 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  50.85 
 
 		 247 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  29.81 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.05 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  45.07 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.11 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  38.55 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  38.38 
 
 		 537 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  39.08 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.59 
 
 		 449 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 130 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.26 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  38.35 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0977  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0814566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 		 182 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  31.85 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 108 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  36.28 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.38 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.78 
 
 		 526 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 		 189 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 		 446 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 		 567 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  36.96 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 		 862 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 206 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 206 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>