More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0431 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 325 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  60.94 
 
 		 319 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  53.63 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  49.2 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  49.2 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  52.47 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  48.56 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  47.62 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  47.08 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.36 
 
 		 328 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  42.2 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  42.73 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  45.73 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  42.73 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  44.31 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  44.62 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  42.73 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  43.47 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  42.2 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  37.72 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  40 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  43.81 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  45.56 
 
 		 326 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 330 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  46.41 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  43.16 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1198  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  43.26 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  41.9 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  41.9 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  41.12 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  44 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  44.44 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  41.59 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  43.29 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  42.15 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  39.14 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  42.73 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  36.96 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  39.38 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  40.81 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  42.12 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  42.3 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  36.06 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  38.72 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  39.52 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  42.22 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  41.18 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  38.23 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  41.34 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  37.88 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  39.76 
 
 		 334 aa  228  7e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  42.99 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  38.07 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  40.67 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  43.48 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  43.71 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  38.94 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  41.18 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 		 338 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  38.27 
 
 		 324 aa  226  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  44.58 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  41.09 
 
 		 332 aa  225  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  36.16 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  41.39 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  37.58 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>