More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2844 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  84.48 
 
 		 117 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  76.47 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  70.91 
 
 		 134 aa  166  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  70.91 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  60.75 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  60.75 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  40.91 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 128 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 102 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  36.11 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  35.04 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.68 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  32.48 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  32.48 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  36 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  43.68 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  36.75 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  33.62 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  33.62 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  32.48 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  34.58 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  32.5 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2830  30S ribosomal protein S6  32.48 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  34.71 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  36.28 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  31.62 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  35.65 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  35.65 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  33.05 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  32.67 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  37.86 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  41.38 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  41.38 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  32.69 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  40.23 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  35.24 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  32.35 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>