221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0265 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3159  mutT/nudix family protein  77.22 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  58.29 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2953  NUDIX hydrolase  56.19 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3448  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0855  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10636  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07260)  40.77 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0079  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.886246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  29.83 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  34.48 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  37.69 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02040  expressed protein  36.89 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.71 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.47 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.12 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.47 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  35.71 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.12 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.12 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  31.76 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.91 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  33.08 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  29.38 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  24.74 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  29.89 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  36 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  25.3 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1011  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000869089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  29.1 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2950  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.639343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>