218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0038 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  70.79 
 
 		 606 aa  876    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  70.81 
 
 		 605 aa  889    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  89.92 
 
 		 610 aa  1088    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  72.11 
 
 		 606 aa  905    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  57.74 
 
 		 603 aa  708    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  69.97 
 
 		 606 aa  890    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  100 
 
 		 605 aa  1214    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  70.13 
 
 		 606 aa  889    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  55.26 
 
 		 608 aa  681    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  51.98 
 
 		 604 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  68.26 
 
 		 605 aa  873    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  67.73 
 
 		 606 aa  843    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  71.62 
 
 		 605 aa  913    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  66.34 
 
 		 606 aa  858    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  67.16 
 
 		 606 aa  853    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  70.96 
 
 		 606 aa  879    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  52.69 
 
 		 597 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  50.83 
 
 		 611 aa  620  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  40.84 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  38.07 
 
 		 620 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  36.6 
 
 		 639 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  37.03 
 
 		 620 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  36.26 
 
 		 620 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  37.62 
 
 		 621 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  35.28 
 
 		 625 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  36.68 
 
 		 620 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  36.17 
 
 		 634 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  36.39 
 
 		 652 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  35.62 
 
 		 634 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  35.08 
 
 		 644 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  36.78 
 
 		 644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  36.54 
 
 		 653 aa  336  7.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  38.13 
 
 		 630 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  35.43 
 
 		 622 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  34.61 
 
 		 620 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  37.16 
 
 		 647 aa  330  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  36.64 
 
 		 636 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  36.59 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  36.38 
 
 		 614 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.86 
 
 		 630 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  35.56 
 
 		 626 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  34.82 
 
 		 648 aa  323  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  36.54 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  35.05 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  36.02 
 
 		 631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  36.48 
 
 		 622 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  36.48 
 
 		 622 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  35.84 
 
 		 633 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  35.02 
 
 		 627 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  35.66 
 
 		 622 aa  319  7e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  33.23 
 
 		 631 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  35.31 
 
 		 624 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  36.79 
 
 		 622 aa  319  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  36.88 
 
 		 639 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  35.2 
 
 		 680 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  37.57 
 
 		 634 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  33.23 
 
 		 631 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  34.73 
 
 		 637 aa  316  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  35.94 
 
 		 656 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.79 
 
 		 640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  33.71 
 
 		 628 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  35.86 
 
 		 670 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  34.08 
 
 		 634 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  33.92 
 
 		 672 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  34.78 
 
 		 634 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  33.49 
 
 		 651 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  34.19 
 
 		 664 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  36.05 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  33.71 
 
 		 628 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  32.74 
 
 		 628 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  35.7 
 
 		 671 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  35.65 
 
 		 671 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  33.18 
 
 		 651 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  34.02 
 
 		 660 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  35.62 
 
 		 634 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  34.14 
 
 		 611 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  35.6 
 
 		 636 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  35.76 
 
 		 632 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  35.1 
 
 		 633 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  35.74 
 
 		 661 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  34.47 
 
 		 656 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  35.38 
 
 		 637 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  35.27 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  33.86 
 
 		 660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  35.44 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  34.94 
 
 		 633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  33.82 
 
 		 630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  33.82 
 
 		 630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  36.89 
 
 		 651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  35.27 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  35.71 
 
 		 633 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  33.82 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  34.38 
 
 		 629 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  33.82 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  33.82 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  33.82 
 
 		 622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  32.76 
 
 		 628 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  34.75 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  36.62 
 
 		 634 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  33.86 
 
 		 638 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>