218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1173 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  74.75 
 
 		 606 aa  946    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  71.45 
 
 		 605 aa  904    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  67.16 
 
 		 610 aa  840    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  95.54 
 
 		 606 aa  1169    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  67 
 
 		 606 aa  862    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  100 
 
 		 606 aa  1224    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  57.67 
 
 		 603 aa  716    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  67.33 
 
 		 606 aa  855    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  67.16 
 
 		 605 aa  842    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  69.31 
 
 		 606 aa  895    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  56.13 
 
 		 608 aa  669    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  73.93 
 
 		 606 aa  914    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  69.64 
 
 		 605 aa  883    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  73.33 
 
 		 605 aa  926    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  67.33 
 
 		 606 aa  858    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  52.52 
 
 		 604 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  57.07 
 
 		 597 aa  694    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  51.34 
 
 		 611 aa  632  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  42.46 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  39.49 
 
 		 620 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  39.22 
 
 		 634 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  38.34 
 
 		 636 aa  360  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  38.44 
 
 		 631 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  38.04 
 
 		 621 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  37.14 
 
 		 620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  37.08 
 
 		 620 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  36.98 
 
 		 639 aa  352  8e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  36.62 
 
 		 652 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  37.75 
 
 		 644 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  37.09 
 
 		 630 aa  350  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  36.54 
 
 		 620 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  37.28 
 
 		 656 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  35.95 
 
 		 626 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  35.93 
 
 		 625 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  36.92 
 
 		 622 aa  347  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  36.2 
 
 		 620 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  37 
 
 		 634 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  35.24 
 
 		 630 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  35.32 
 
 		 651 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  36.8 
 
 		 670 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  35.76 
 
 		 622 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  35.17 
 
 		 639 aa  341  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  36.35 
 
 		 624 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  36.64 
 
 		 671 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  36.68 
 
 		 634 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  36.13 
 
 		 622 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  36.13 
 
 		 622 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  36.39 
 
 		 628 aa  339  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  34.62 
 
 		 634 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  36.23 
 
 		 632 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  35 
 
 		 651 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  35.59 
 
 		 622 aa  339  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  35.14 
 
 		 660 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  36.73 
 
 		 647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  35.18 
 
 		 628 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  36.08 
 
 		 637 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  36.48 
 
 		 671 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  35.56 
 
 		 644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  34.78 
 
 		 672 aa  336  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  34.47 
 
 		 648 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  36.19 
 
 		 622 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  35.43 
 
 		 627 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  35.57 
 
 		 660 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  35.82 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  35.57 
 
 		 630 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  35.57 
 
 		 630 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  34.8 
 
 		 651 aa  335  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  35.9 
 
 		 634 aa  334  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  35.1 
 
 		 622 aa  334  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  35.75 
 
 		 632 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  35.69 
 
 		 628 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  35.43 
 
 		 637 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  33.82 
 
 		 661 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  36.29 
 
 		 628 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  36.32 
 
 		 632 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  35.31 
 
 		 680 aa  334  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  35.41 
 
 		 622 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  34.93 
 
 		 630 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  35.38 
 
 		 638 aa  333  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  35.43 
 
 		 622 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  34.93 
 
 		 630 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  34.93 
 
 		 630 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  35.75 
 
 		 637 aa  332  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.68 
 
 		 640 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  35.59 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  35.85 
 
 		 638 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  37.5 
 
 		 614 aa  331  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  35.1 
 
 		 637 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  35.41 
 
 		 636 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  34.83 
 
 		 611 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  35.74 
 
 		 622 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  36.81 
 
 		 633 aa  330  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  35.48 
 
 		 622 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  35.48 
 
 		 622 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  34.67 
 
 		 632 aa  329  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  35.32 
 
 		 688 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  35.78 
 
 		 653 aa  329  9e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  35.32 
 
 		 638 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.91 
 
 		 647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  35.42 
 
 		 634 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>