218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0532 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  71.19 
 
 		 605 aa  915    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  68.52 
 
 		 610 aa  855    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  73.93 
 
 		 606 aa  914    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  72.44 
 
 		 606 aa  917    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  100 
 
 		 606 aa  1227    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  73.43 
 
 		 606 aa  917    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  58.79 
 
 		 603 aa  720    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  68.65 
 
 		 606 aa  884    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  66.34 
 
 		 605 aa  844    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  70.63 
 
 		 606 aa  910    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  65.68 
 
 		 606 aa  830    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  65.84 
 
 		 606 aa  829    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  67.82 
 
 		 605 aa  862    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  56.9 
 
 		 608 aa  689    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  74.87 
 
 		 605 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  55.78 
 
 		 597 aa  669    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  51.6 
 
 		 604 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  50.17 
 
 		 611 aa  622  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  42.17 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  35.63 
 
 		 639 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  36.45 
 
 		 625 aa  360  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  37.5 
 
 		 634 aa  356  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  36.86 
 
 		 634 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  37.1 
 
 		 631 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  37.42 
 
 		 622 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  36.44 
 
 		 636 aa  346  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  35.32 
 
 		 627 aa  346  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  36.54 
 
 		 634 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  35.65 
 
 		 622 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  35.82 
 
 		 653 aa  343  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  36.01 
 
 		 624 aa  343  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  36.38 
 
 		 634 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  35.23 
 
 		 620 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  38.3 
 
 		 639 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  35.93 
 
 		 621 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  36.86 
 
 		 614 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  37.14 
 
 		 620 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  36.72 
 
 		 620 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  38.83 
 
 		 670 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  35.58 
 
 		 620 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  35.96 
 
 		 656 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  35.8 
 
 		 633 aa  337  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.6 
 
 		 630 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  35.77 
 
 		 632 aa  334  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  35.54 
 
 		 634 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  35.6 
 
 		 644 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  33.66 
 
 		 644 aa  333  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  34.78 
 
 		 622 aa  333  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  35.3 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  38.05 
 
 		 671 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  34.69 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.48 
 
 		 640 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  35.45 
 
 		 647 aa  330  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  34.46 
 
 		 636 aa  329  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  34.46 
 
 		 651 aa  329  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  34.02 
 
 		 620 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  34.18 
 
 		 622 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  34.35 
 
 		 628 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  37.87 
 
 		 671 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  34.13 
 
 		 651 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  37.43 
 
 		 626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  35.3 
 
 		 633 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  34.34 
 
 		 622 aa  327  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  34.34 
 
 		 622 aa  327  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  34.46 
 
 		 637 aa  327  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  35.81 
 
 		 628 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  35.02 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  34.35 
 
 		 637 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  36.53 
 
 		 611 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  34.46 
 
 		 643 aa  323  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  33.71 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  33.71 
 
 		 651 aa  323  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  33.71 
 
 		 622 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  35.79 
 
 		 622 aa  321  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  35.79 
 
 		 622 aa  321  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  36.03 
 
 		 652 aa  320  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  34.19 
 
 		 622 aa  320  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  34.09 
 
 		 637 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  36.68 
 
 		 629 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  33.33 
 
 		 661 aa  319  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  33.71 
 
 		 622 aa  319  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  33.6 
 
 		 656 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  33.87 
 
 		 622 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  34.35 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  33.33 
 
 		 672 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  35.35 
 
 		 664 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  35.45 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  36.83 
 
 		 629 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  35.28 
 
 		 630 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.06 
 
 		 647 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  34.25 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  34.14 
 
 		 632 aa  316  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  35.4 
 
 		 633 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  34.35 
 
 		 622 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  33.92 
 
 		 631 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  34.67 
 
 		 632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0462  potassium uptake protein, Kup system  35.25 
 
 		 620 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0831173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  34.24 
 
 		 628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  33.82 
 
 		 631 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  33.49 
 
 		 637 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>