219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3225 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  73.51 
 
 
605 aa  932    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  70.13 
 
 
610 aa  879    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  69.47 
 
 
606 aa  882    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  53.37 
 
 
604 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  69.97 
 
 
606 aa  884    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  57.74 
 
 
603 aa  705    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  69.97 
 
 
605 aa  879    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  72.61 
 
 
606 aa  917    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  70.46 
 
 
606 aa  900    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  100 
 
 
606 aa  1222    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  73.93 
 
 
605 aa  929    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  74.75 
 
 
606 aa  946    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  72.44 
 
 
606 aa  917    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  55.94 
 
 
608 aa  692    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  75.25 
 
 
605 aa  949    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  56.9 
 
 
597 aa  692    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  74.75 
 
 
606 aa  946    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  50.17 
 
 
611 aa  622  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  40.75 
 
 
607 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  36.5 
 
 
622 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  36.33 
 
 
620 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  37.36 
 
 
625 aa  350  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  39.8 
 
 
630 aa  343  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  36.51 
 
 
620 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  35.76 
 
 
620 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  35.53 
 
 
620 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  36.06 
 
 
632 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  34.76 
 
 
627 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  36.23 
 
 
652 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  35.97 
 
 
632 aa  339  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  34.71 
 
 
622 aa  339  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  35.44 
 
 
651 aa  339  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  35.46 
 
 
621 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  35.44 
 
 
651 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  35.34 
 
 
624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  35.42 
 
 
620 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  34.78 
 
 
639 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  36.04 
 
 
626 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  34.49 
 
 
622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  35.32 
 
 
611 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  35.13 
 
 
651 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  37 
 
 
647 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  36.07 
 
 
644 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  34.66 
 
 
630 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  36.08 
 
 
622 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  35.85 
 
 
639 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  35.57 
 
 
653 aa  334  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  34.9 
 
 
628 aa  333  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  36.62 
 
 
634 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  34.7 
 
 
622 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  34.7 
 
 
622 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  37.28 
 
 
636 aa  331  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  36.48 
 
 
634 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  34.57 
 
 
622 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  34.15 
 
 
644 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  36.68 
 
 
631 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  35.7 
 
 
622 aa  329  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  36.82 
 
 
670 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  36.66 
 
 
671 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  36.66 
 
 
671 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  35.75 
 
 
634 aa  328  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  34.61 
 
 
672 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  34.79 
 
 
631 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  35.81 
 
 
634 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  34.53 
 
 
648 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  35.41 
 
 
633 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.95 
 
 
640 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  35.54 
 
 
629 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  34.64 
 
 
628 aa  325  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  34.73 
 
 
636 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  35.12 
 
 
633 aa  324  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  36.18 
 
 
629 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  35.02 
 
 
634 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  35.1 
 
 
634 aa  323  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  35.53 
 
 
666 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  35.67 
 
 
680 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  35.45 
 
 
633 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  34.57 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  36.7 
 
 
614 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  35.44 
 
 
637 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  34.48 
 
 
631 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  35.05 
 
 
655 aa  320  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  35.21 
 
 
622 aa  320  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  33.17 
 
 
661 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  35.47 
 
 
637 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  36.33 
 
 
656 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  35.21 
 
 
622 aa  317  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  38.01 
 
 
622 aa  316  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.7 
 
 
647 aa  316  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  35.06 
 
 
637 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  36.35 
 
 
658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  38.01 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  35.06 
 
 
643 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>