219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1248 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  100 
 
 
607 aa  1202    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  46.51 
 
 
603 aa  534  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  43.16 
 
 
611 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  43.46 
 
 
606 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  43.57 
 
 
605 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  42.1 
 
 
606 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  42.28 
 
 
605 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  42.23 
 
 
606 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  42.79 
 
 
597 aa  486  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  41.35 
 
 
605 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  41.32 
 
 
604 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  43.29 
 
 
605 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  41.95 
 
 
606 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  43 
 
 
608 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  42.46 
 
 
606 aa  482  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  41.85 
 
 
610 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  43.09 
 
 
606 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  41.19 
 
 
606 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  40.75 
 
 
606 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  32.11 
 
 
664 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  32 
 
 
621 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  30.99 
 
 
620 aa  317  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  33.55 
 
 
636 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  34.83 
 
 
625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  32.91 
 
 
656 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  36.65 
 
 
622 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  33.17 
 
 
631 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  33.82 
 
 
633 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  33.12 
 
 
624 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  32.49 
 
 
622 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  36.01 
 
 
622 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  36.01 
 
 
622 aa  300  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  32.96 
 
 
631 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  31.86 
 
 
630 aa  299  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  31.61 
 
 
614 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  31.88 
 
 
628 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  32.86 
 
 
637 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  32.33 
 
 
622 aa  297  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4647  K potassium transporter  34.38 
 
 
654 aa  297  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  33.81 
 
 
622 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  32.33 
 
 
622 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  31.62 
 
 
672 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  32.64 
 
 
632 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  32.27 
 
 
660 aa  296  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  34.02 
 
 
631 aa  296  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  32.54 
 
 
630 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  32.54 
 
 
660 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  32.38 
 
 
661 aa  296  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  32.54 
 
 
630 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  32.54 
 
 
630 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  32.54 
 
 
630 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  32.54 
 
 
630 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  32.56 
 
 
620 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  32.54 
 
 
622 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  33.7 
 
 
629 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  31.96 
 
 
620 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  35.63 
 
 
642 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  36.22 
 
 
642 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  32.04 
 
 
620 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  35.17 
 
 
622 aa  293  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  34.14 
 
 
629 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  32.9 
 
 
622 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  33.52 
 
 
630 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  33.01 
 
 
633 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  33.01 
 
 
638 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  32.63 
 
 
633 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  32.49 
 
 
630 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  31.58 
 
 
628 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  34.88 
 
 
622 aa  290  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  31.26 
 
 
626 aa  289  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  32.69 
 
 
643 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  32.37 
 
 
653 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  32.8 
 
 
652 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  32.58 
 
 
644 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  30.94 
 
 
628 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  31.63 
 
 
620 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  32.15 
 
 
638 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  32.15 
 
 
688 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  32.15 
 
 
638 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  31.56 
 
 
627 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  31.99 
 
 
638 aa  286  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  32.64 
 
 
637 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  33.12 
 
 
656 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  32.76 
 
 
628 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  30.94 
 
 
628 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  33.21 
 
 
655 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  31.78 
 
 
637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  36.31 
 
 
646 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  31.94 
 
 
632 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  31.96 
 
 
647 aa  283  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  32.05 
 
 
634 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  32.02 
 
 
622 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  32.06 
 
 
622 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  32.02 
 
 
622 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>