227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3383 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3383  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 313 aa  646    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1607  putative ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2881  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  27.91 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.22 
 
 		 348 aa  89.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.09 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.38 
 
 		 779 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.11 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  23.75 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.8 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.15 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.61 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.7 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3797  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.07 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  23.96 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.09 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.59 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  25.47 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.58 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  25.28 
 
 		 781 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.36 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.92 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.44 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.23 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.31 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.41 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.13 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  23.31 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.64 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.64 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.48 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.1 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  21.74 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.13 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  22.68 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.96 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.13 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  22.4 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  22.4 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.41 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.12 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.32 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.49 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  23.65 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  22.62 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.22 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.03 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.03 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.03 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.22 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  31.52 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  24.17 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.98 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  19.65 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.17 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.23 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.31 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.05 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  24.3 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22.87 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.67 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.5 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  20.75 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  20.88 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.41 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  22.16 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.08 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  31.43 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.19 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0634  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  23.49 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415835  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.07 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.71 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  36.46 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  23.13 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  20.48 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.63 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  20.48 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  35.56 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  20.5 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0235  lipopolysaccharide heptosyltransferase 1  23.63 
 
 		 350 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  21.35 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  24.7 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.23 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.4 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  18.44 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  21.66 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.55 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.99 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  21.83 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>