186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0787 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0787  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 531 aa  1090    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0727  hypothetical protein  34.32 
 
 		 330 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2668  pyruvate carboxyltransferase  25.09 
 
 		 539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1791  aldolase/synthase, putative  25.19 
 
 		 534 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2735  hypothetical protein  29.17 
 
 		 295 aa  97.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2608  hypothetical protein  28.79 
 
 		 295 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3072  HMG-CoA lyase-like  28.52 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0140  pyruvate carboxyltransferase  28.97 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000672144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0987  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.861522  normal  0.983085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2258  pyruvate carboxyltransferase  28.06 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13506  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.28 
 
 		 336 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  25.21 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.46 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.34 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.82 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.09 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.94 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.37 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.01 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  25 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.48 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1083  pyruvate carboxyltransferase  25.09 
 
 		 311 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  25.19 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  25.29 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.5 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  25 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  25 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.82 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.78 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  25.29 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  25.78 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.97 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  25.57 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  23.95 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  25.29 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.19 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  23.9 
 
 		 502 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.51 
 
 		 349 aa  57  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.79 
 
 		 342 aa  57  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0128  pyruvate carboxyltransferase  21.99 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.2 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.43 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  26.2 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  24.43 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.95 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.66 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  27.47 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.98 
 
 		 339 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  24.43 
 
 		 505 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.78 
 
 		 340 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  22.51 
 
 		 333 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  24.81 
 
 		 509 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  25.76 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  25.48 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  22.81 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.67 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  24.29 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.76 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.76 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.76 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  22.55 
 
 		 377 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.76 
 
 		 337 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  26.85 
 
 		 514 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.93 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  24.03 
 
 		 507 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  25.59 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.33 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1723  2-isopropylmalate synthase  25.79 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  26.49 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.59 
 
 		 336 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.82 
 
 		 340 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  25.99 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  22.83 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.02 
 
 		 345 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  26.15 
 
 		 516 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  24.28 
 
 		 514 aa  50.8  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  23.26 
 
 		 514 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.65 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.65 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  22.52 
 
 		 515 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  24.43 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  22.13 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  22.87 
 
 		 517 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.34 
 
 		 337 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.41 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  24.51 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  23.91 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.89 
 
 		 339 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  22.13 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  22.87 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  23.08 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  22.13 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  22.8 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  24.53 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  25.58 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.25 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  22.78 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.6 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  25.87 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.6 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>