More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2608 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2608  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2735  hypothetical protein  97.63 
 
 
295 aa  590  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3072  HMG-CoA lyase-like  35.34 
 
 
342 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357205  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0987  hypothetical protein  31.82 
 
 
344 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.861522  normal  0.983085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1791  aldolase/synthase, putative  31.15 
 
 
534 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  31.25 
 
 
338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13506  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.39 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1083  pyruvate carboxyltransferase  33.2 
 
 
311 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0140  pyruvate carboxyltransferase  30.58 
 
 
352 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000672144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.52 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.74 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.45 
 
 
333 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.21 
 
 
341 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29 
 
 
346 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.63 
 
 
351 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.98 
 
 
353 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.42 
 
 
340 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.54 
 
 
342 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
353 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.77 
 
 
363 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
353 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
353 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.59 
 
 
352 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.67 
 
 
344 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.03 
 
 
346 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0727  hypothetical protein  29.68 
 
 
330 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.59 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.3 
 
 
350 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.08 
 
 
343 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.99 
 
 
358 aa  99  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2258  pyruvate carboxyltransferase  28.26 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.72 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  25.19 
 
 
348 aa  96.3  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.92 
 
 
350 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0787  pyruvate carboxyltransferase  28.79 
 
 
531 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.08 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.74 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2668  pyruvate carboxyltransferase  26.82 
 
 
539 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.4 
 
 
342 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.4 
 
 
352 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3808  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.2 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.47 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.13 
 
 
349 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  26.07 
 
 
377 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.85 
 
 
339 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.89 
 
 
350 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.09 
 
 
355 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.92 
 
 
339 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.69 
 
 
358 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.52 
 
 
344 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  26.39 
 
 
349 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.96 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.57 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.52 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.02 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2266  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.07 
 
 
349 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.22 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.88 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.88 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.22 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.06 
 
 
339 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.22 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.89 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.69 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30.38 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.38 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.38 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.23 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.96 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4142  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.24 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345683  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2781  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.17 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.018657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.54 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.38 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.29 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.24 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.54 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  30.54 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.5 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.8 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.54 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3340  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.68 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.52 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.36 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1102  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  27.78 
 
 
526 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.41 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.92 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4833  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  24.65 
 
 
354 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845453  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.8 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.58 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.96 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.54 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.51 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.11 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.11 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48570  putative 2-isopropylmalate synthase  23.96 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251079  normal  0.0168935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.11 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>