More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2116 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  100 
 
 
340 aa  690    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  76.2 
 
 
339 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  73.45 
 
 
346 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4142  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  73.45 
 
 
346 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345683  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3340  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  70.88 
 
 
345 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2266  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  72.54 
 
 
349 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  72.78 
 
 
348 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2781  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  71.68 
 
 
344 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.018657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  70.5 
 
 
345 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  72.78 
 
 
348 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  71.47 
 
 
348 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  70.8 
 
 
343 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1356  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  71.98 
 
 
341 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315609  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3782  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  71.98 
 
 
343 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132255  hitchhiker  0.000807704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  73.13 
 
 
348 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  70.21 
 
 
342 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  69.85 
 
 
342 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1390  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  72.86 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1457  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  74.34 
 
 
343 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322721  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  73.05 
 
 
342 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  69.91 
 
 
343 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  64.5 
 
 
358 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  63.31 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3808  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  62.83 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669855 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.39 
 
 
342 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.82 
 
 
353 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.39 
 
 
347 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.03 
 
 
346 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  55.15 
 
 
352 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  53.99 
 
 
377 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.49 
 
 
337 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.6 
 
 
337 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  54.6 
 
 
337 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.6 
 
 
355 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.31 
 
 
350 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.6 
 
 
337 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.6 
 
 
337 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.33 
 
 
341 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.57 
 
 
342 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.01 
 
 
337 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0938  pyruvate carboxyltransferase  54.79 
 
 
344 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.79 
 
 
349 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.36 
 
 
349 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.79 
 
 
345 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.12 
 
 
340 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.31 
 
 
339 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.81 
 
 
339 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.3 
 
 
337 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.01 
 
 
337 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  54.01 
 
 
337 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.43 
 
 
339 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.15 
 
 
338 aa  362  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.98 
 
 
340 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1479  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  53.87 
 
 
346 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3510  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  54.9 
 
 
349 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.08 
 
 
337 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.25 
 
 
336 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.35 
 
 
345 aa  359  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.68 
 
 
339 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.22 
 
 
338 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.58 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.43 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.23 
 
 
352 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.52 
 
 
349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.36 
 
 
349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.36 
 
 
349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4923  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.99 
 
 
341 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854205  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.08 
 
 
340 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.89 
 
 
338 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.41 
 
 
341 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.55 
 
 
346 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.04 
 
 
343 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  49.54 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.34 
 
 
338 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.19 
 
 
352 aa  342  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.19 
 
 
350 aa  342  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.19 
 
 
353 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.89 
 
 
353 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.89 
 
 
353 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.04 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  49.11 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  48.63 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  53.52 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  48.35 
 
 
355 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.96 
 
 
343 aa  332  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.96 
 
 
336 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.19 
 
 
352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.36 
 
 
338 aa  325  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  50.47 
 
 
349 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  48.62 
 
 
351 aa  321  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3900  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.14 
 
 
351 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.577323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3525  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.91 
 
 
351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  44.61 
 
 
333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  42.42 
 
 
333 aa  265  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  40.92 
 
 
348 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.16 
 
 
347 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.16 
 
 
347 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.16 
 
 
347 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4833  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  40 
 
 
354 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845453  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.55 
 
 
347 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>