More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5042 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  95.74 
 
 
352 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  98.27 
 
 
363 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  92.42 
 
 
346 aa  649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  99.72 
 
 
353 aa  718    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  100 
 
 
353 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  99.72 
 
 
353 aa  718    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  95.71 
 
 
350 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  76.9 
 
 
358 aa  551  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  75.44 
 
 
344 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  70.19 
 
 
349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  63.64 
 
 
349 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  61.75 
 
 
355 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  61.66 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  56.29 
 
 
343 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.26 
 
 
338 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.04 
 
 
342 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.9 
 
 
341 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.55 
 
 
341 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.19 
 
 
340 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.52 
 
 
336 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  48.38 
 
 
352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.89 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.85 
 
 
346 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.1 
 
 
342 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  46.39 
 
 
338 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.54 
 
 
353 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.95 
 
 
350 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  50.91 
 
 
337 aa  329  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.91 
 
 
337 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.91 
 
 
337 aa  329  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.91 
 
 
337 aa  328  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.91 
 
 
337 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  50.91 
 
 
337 aa  328  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
343 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.53 
 
 
337 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.1 
 
 
345 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3782  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132255  hitchhiker  0.000807704 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.39 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2781  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.3 
 
 
344 aa  326  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.018657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1356  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
341 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315609  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.3 
 
 
337 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  46.67 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.05 
 
 
347 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.3 
 
 
337 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1390  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.39 
 
 
339 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  46.95 
 
 
350 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4142  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.4 
 
 
346 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345683  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.55 
 
 
343 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.48 
 
 
348 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.48 
 
 
348 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.55 
 
 
355 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.09 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3340  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.3 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3808  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  45.18 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.77 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.55 
 
 
340 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.19 
 
 
348 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.7 
 
 
340 aa  318  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.87 
 
 
342 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.7 
 
 
339 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.89 
 
 
342 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.12 
 
 
349 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.85 
 
 
345 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2266  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.69 
 
 
349 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.78 
 
 
345 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.7 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.55 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  46.87 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  49.09 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.33 
 
 
349 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.33 
 
 
349 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.64 
 
 
352 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.64 
 
 
338 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.18 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1479  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  49.25 
 
 
346 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0938  pyruvate carboxyltransferase  48.47 
 
 
344 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3510  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  48.16 
 
 
349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1457  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.76 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.47 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.94 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.79 
 
 
343 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.54 
 
 
349 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  46.41 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.1 
 
 
345 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.8 
 
 
340 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  47.42 
 
 
342 aa  305  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4923  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.37 
 
 
341 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854205  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.08 
 
 
338 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  45.27 
 
 
351 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3525  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  45.2 
 
 
351 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3900  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  46.18 
 
 
351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.577323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  37.65 
 
 
333 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.79 
 
 
333 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  38.72 
 
 
348 aa  225  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4833  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  37.84 
 
 
354 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845453  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.5 
 
 
347 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.5 
 
 
347 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.5 
 
 
347 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  36.9 
 
 
347 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>