More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2454 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  99.42 
 
 
347 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  96.83 
 
 
347 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  100 
 
 
347 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  100 
 
 
347 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  51.56 
 
 
348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.17 
 
 
333 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4833  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  47.76 
 
 
354 aa  288  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845453  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  42.42 
 
 
338 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  42.73 
 
 
341 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.8 
 
 
341 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.87 
 
 
342 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3808  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.87 
 
 
354 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  41.82 
 
 
344 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.54 
 
 
350 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.84 
 
 
342 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.16 
 
 
340 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.12 
 
 
347 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.16 
 
 
339 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.71 
 
 
350 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.18 
 
 
339 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.55 
 
 
343 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.12 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  42.03 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.36 
 
 
358 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  40.18 
 
 
352 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.07 
 
 
352 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  39.18 
 
 
355 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.23 
 
 
339 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.06 
 
 
346 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.07 
 
 
355 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.21 
 
 
339 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.94 
 
 
338 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  38.39 
 
 
358 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.69 
 
 
345 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.34 
 
 
342 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.82 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.74 
 
 
352 aa  222  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.19 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  37.98 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.71 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.19 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1390  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.76 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.5 
 
 
353 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.61 
 
 
340 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.5 
 
 
353 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.5 
 
 
353 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  36.76 
 
 
350 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.1 
 
 
346 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.55 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.3 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.51 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.21 
 
 
337 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3510  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  38.82 
 
 
349 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0938  pyruvate carboxyltransferase  40.36 
 
 
344 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.85 
 
 
339 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.43 
 
 
363 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.18 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.51 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  34.24 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3340  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.51 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.87 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  39.46 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.06 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.46 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.46 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.46 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  37.58 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  40.62 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  41.42 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.46 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.46 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  39.46 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.76 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  40.37 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  36.22 
 
 
351 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  36.39 
 
 
352 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  38.64 
 
 
377 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.86 
 
 
337 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1479  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  38.77 
 
 
346 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.65 
 
 
343 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.72 
 
 
345 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4142  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.61 
 
 
346 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345683  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.05 
 
 
348 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.05 
 
 
348 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.95 
 
 
348 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4923  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.46 
 
 
341 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854205  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.21 
 
 
342 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.11 
 
 
348 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.69 
 
 
338 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.16 
 
 
343 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2781  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.35 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.018657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2266  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.76 
 
 
349 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.16 
 
 
338 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.05 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  36.42 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1356  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  35.93 
 
 
341 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315609  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3782  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  35.84 
 
 
343 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132255  hitchhiker  0.000807704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1457  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  37.43 
 
 
343 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322721  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3900  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  38.57 
 
 
351 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.577323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3525  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.53 
 
 
351 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>